#04b的新冠速報
這幾天大大小小消息很多,一個一個寫有點應接不暇,來個速報好了。
1.以七日平均新增案例來看,全世界前十名疫情嚴峻的國家如圖。美國單日20萬例已經是家常便飯。英國衝破6萬例,以人口密度來看比美國更嚴峻。再來是巴西,俄羅斯,印度。法國,德國,義大利,西班牙的第二波在下降中,但有點要反彈的跡象。
2.日本首相菅義偉7日宣布,針對首都圈1都3縣(東京都、千葉縣、神奈川縣、埼玉縣)發布「緊急事態宣言」,8日零時起生效,為期一個月到2月7日止。京阪神因為疫情同創新高,有意籲請中央也納入緊急事態地區。
3.東京都7日新增2447例確診病例,繼6日的1591例後,連2天創單日新高紀錄。重症患者數也較昨天增加8人,總數121人,同創歷史新高。
每星期四常常是東京確診數最多的時候,因為東京的PCR檢查是反應約三天前星期一收件的結果。1月4日檢件數逾1萬5000件,因為新年假期結束,也是確診病例數爆增的原因。這要用七日平均的趨勢繼續看下去會比較準確。但東京疫情在往上走,這是無庸置疑的。目前公布1月3日的七日PCR陽性率12.9%,4日這樣算起來是16.3%左右。
4.英國MHRA公布了牛津疫苗詳細的評估報告,我大致看完了保護力怎麼計算出來的部份。我初步感想是,下這樣結論的樣本數太少了....下週一直播和大家詳細解說。(連結放在留言處)
5.美國加州目前是重災區。聖地牙哥郡已經驗出32例英國變種病毒案例,有可能早已在此深入社區。
6.中國科興疫苗,在巴西做臨床試驗的那個,據稱保護力是78%。
中國科興疫苗第三期臨床研究於巴西、土耳其及印尼進行,之前兩度延遲公佈數據。參與科興第三期臨床研究的巴西布坦坦研究所原定上月底公佈研究結果,但於記者會上指,科興要求推遲到本月才公佈研究結果,因需將巴西、印尼及土耳其的數據整合。
而路透社引述消息指,科興疫苗於巴西第三期臨床研究顯示有效率為78%,但報道只引述消息指出巴西的臨床研究數據,未有綜合科興在印尼及土耳其的研究數據,也未有詳細的研究內容。之前土耳其指中期數據顯示疫苗有效率為91.25%,同樣沒公佈詳細研究內容。
臨床試驗樣本數計算 在 日本自助旅遊中毒者 Facebook 八卦
#AZ疫苗對抗南非變種病毒效力有限?
#南非政府緊急喊停醫護接種計劃
1.新聞報導,牛津大學和南非金山大學進行研究,發現牛津AZ疫苗無法預防南非變種病毒株所引發的輕中症,而南非政府對此也先行暫停對醫護人員施打AZ疫苗計劃。
2.此在南非的2000多人臨床試驗目前還沒看到細節,據說星期一會公布。不過因為受試者多為健康的年輕人,因此無法判定對重症與住院病患的防護力。
3.紐約時報報導,在疫苗組的748人中有19人確診新冠(輕症+中症)。而在對照組中則是714人中有20人。如此計算保護力僅有10%,雖然這個樣本數非常小。
4.南非政府本月原先開始以150萬劑AZ疫苗為前線醫護人員提供接種,但研究結果出來後,南非政府已緊急喊停,目前將加速其他疫苗的訂購作業。南非衛生部長姆赫茲(Zweli Mkhize)表示,原訂本月開始的AZ疫苗接種計劃將暫停,必須要針對疫苗對重症病例的效力進行研究,計劃將暫停到研究單位給出更明確的指示為止。
04b解讀:
1.AZ在南非執行的COV005研究預計收4000人。BBC報導,目前的研究有2000人平均31歲,我不是很確定是不是就是同一個研究。AZ和牛津大學目前也還沒有正式的新聞稿在網頁上發布。
2.對於南非變種病毒就算無法完全防止輕中症,但是否還是可以有效預防重症?這是很重要的問題。因為這接近2000人的數字其實非常小,似乎也完全沒有重症發生,因此無法判斷AZ疫苗是否可以防止重症的產生。這其實在目前公布的許多臨床試驗中也有一樣的情形,雖然臨床試驗有上萬人,但染疫的人中產生重症的數字幾乎都是個位數,到底疫苗可否有效防止住院和重症,應該要拿到更大規模的資料上才能看得到。比方說以色列。
3.另外一個問題是有些人擔心的抗體增強反應(antibody-dependent enhancement, ADE)。就是李秉穎老師2月6日投書蘋果日報所說的"內奸抗體"。打了疫苗又感染南非株,得病會不會施打疫苗無法免疫,反而加重肺部疾病變成重症?至少到目前為止牛津疫苗針對南非株應該還沒有看到這樣的現象。
4.上週2月3日牛津和AZ才公布要發表在Lancet,加入了包括南非1476人的資料。說證明了相隔12週施打比相隔6週好。
結果沒幾天就傳出在南非發現疫苗對輕中症幾乎沒保護力.....真的很暈。這樣要完全重新解讀。
你如果在南非的資料等於是不能用的(因為幾乎沒有保護效果,這株的保護力應該要獨立拉出來看)那你加回原來的臨床試驗要怎麼解讀呀?當然不行這樣加起來分析呀!
5.我想南非這批應該幾乎都是兩劑相隔間隔<6週 還有6~8週施打的。難怪你這樣做出來會得到更支持相隔12週比較有效的結論呀!
6.對於AZ疫苗臨床試驗這種擠牙膏式的臨床試驗公布方法,我真的覺得無限的挫折。
p.s.有更新資料會隨時更新。
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次群分析
#posthoc #subgroup #teaching
許多人都相信西洋的占星術,認為她能預測自己的運勢。依據出生日期決定的占星術黃道十二宮是白羊宮、金牛宮、雙子宮、巨蟹宮、獅子宮、室女宮、天秤宮、天蠍宮、人馬宮、摩羯宮、寶瓶宮、雙魚宮。
1988 年發表的 ISIS-2 (Second International Study of Infarct Survival) 臨床試驗顯示在病人發生疑似急性心肌梗塞之後,併用阿斯匹靈及 streptokinase 可以明顯降低再梗塞、中風及死亡的危險,但是許多人都對阿斯匹靈是否只有在某些病人(例如:年紀、性別、種族等)有效很感興趣,於是他們做了一個很有趣的分析,亦即他們把 17187 人依據占星術的星座分成 12 個次群,結果發現阿斯匹靈對天秤座、雙子座的人是無效的,但是阿斯匹靈卻能神奇地降低摩羯座的人的再梗塞、中風及死亡的危險至ㄧ半以下。可見事後分析中的次群分析是不可靠的,因為事後分析就像是「先射箭再畫靶」一樣。
-次群與暴露(治療)的交互作用(moderation)
• 這是一種觀察性研究,而不是 RCT 的主要/次要終點。
• 主要效果必須是有統計意義的。
• 如果是與連續變項有交互作用,那麼連續變項不能被變成類別/二元變項。
• 次群:必須要事先(不能事後)設定,數目不能太多,必須是基礎(治療前)的資料,各次群的樣本數愈多、愈接近愈好,各次群的共變數愈接近愈好,次群的定義沒有測量誤差,不要看太多的次群、有其他的研究支持。
• 校正干擾因子之後仍然存在。
• 必須要做多重比較的校正。
• 要看交互作用,不要分別看各次群:A 次群有意義、B 次群無意義是沒有任何判斷價值的。
• 需要的樣本數是主要效果的 16 倍:RCT 的樣本數是依據主要效果的統計檢定力 0.8 去計算的,因此交互作用的統計檢定力一定是 << 0.8 的。低統計檢定力會造成假陽性(高估效果量)和假陰性(第二型錯誤)。
• 要估計模式預測的校準與鑑別力、各次群預測的結果/治療的傷害。
• 要估計絕對與相對危險性(絕對危險性比較重要)。
• P: 0.01-0.05(不確定)、0.005-0.01(有意義)、< 0.005 (很有意義)。但是不要純粹用 P 值或用逐步複回歸選擇有意義的交互作用;要用收縮 shrinkage(懲罰 penalized、正規化 regularized、整體 ensemble)回歸選擇有意義的交互作用。
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