台灣公共工程建設除了閒置率高、工程品質受到民眾質疑外，公共建設的進度也遭到國人詬病。
一些公共工程在設計、規劃、招標的過程中都發生問題，比如淡江大橋、桃園機場第三航廈等重大公共建設一再流標，顯示有諸多檢討空間。
106年底工程會仍列管之閒置公共設施統計可看出，該年100件遭列管的閒置設施中，來自外部單位(含民眾通報、專書披露、監察院審計部關切案件及媒體報導)發現之案件數共56件超過半數顯示，工程會主動偵測量能不足有待改進。
根據工程會報告指出我國需活化之公共設施尚有82件，日前工程會表示，近期將進一步逐案盤點執行活化之困難案件，協助各設施管理機關加強活化，我們樂觀其成。然而過往曾發生過活化後又再度閒置的狀況產生，工程會103年起至106年底查核50件活化案件，曾發現4件再度閒置案例。
而工程會對於活化閒置設施的主要措施有二，一是每季召開行政院活化閒置公共設施督導會議，以個案協助的方式，輔導機關解決問題；二是工程會將每年考核地方政府活化績效，如果結果不盡理想，則請相關部會調整或減少補助款，以此督促地方政府重視活化成效。
而近年各機關建設公共設施時，時常會以國際競圖的方式來招標，但因為特殊工法、材料及施工介面整合等均欠缺考量，導致工程數度流標、施工期程延宕及工程預算追加等窘境，去年7月時監察院針對上述狀況向工程會提出糾正案，而目前因國際競圖發生爭議的公共工程共計27件，不僅造成相關工程延宕且浪費國家公帑。
除此之外監察院報告還指出大部分的中央及地方機關以1人獨力承辦者居多，且多半不具備辦理公共工程的專業能力，一旦要負責規模大、介面複雜的國際競圖案件，人力及專業難免不足，且重大建設之規劃設計、乃至於施工期程，往往長達5年甚至10年以上，若遇政策更迭或是承辦人員替換，僅有一人恐造成業務交辦上的疏漏，且無助於經驗上的傳承。
面對公共工程爭議時，公共工程委員會一直以仲裁、輔導、監督的腳色自居，但是卻忽略了中央或地方機關量能或承辦人員專業不足的狀況，造成相關爭議 持續發生，工程會應本於職權化被動為主動，確保我國公共建設的量能與品質。
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