宇昌生技採專案核定，是在國發基金相關的審議要點內，這並非首例，如台積電、中華電信等程序都相同。
針對今早「解密記者會」中提出的兩份文件，何美玥表示：
「第一份簽呈主旨標明『請鑒核』代表這是上呈至院長，請求核示准或不准的公文，關於計畫是否決行，故需院長授權、核定。
第二份主旨為『請鑒查』，代表只是告知行政院談判進度，無核示問題，故報備至副院長即可。這是一般的公文流程！我所接觸的宇昌案公文內，完全沒有任何公文提及蔡英文將會是宇昌公司主要經營者！我以人格保證！」
2007年3月30日、31日，宇昌生技的法人說明會，蔡英文、蔡家成員及蔡家企業相關成員皆沒有出席，蔡家成員更沒有講欲投資宇昌、成立公司，也沒有蔡英文欲擔任董事長這件事！這都可以透過說明會的紀錄可以得知。
2007年5月20日，因蘇貞昌院長參與2008年總統大選黨內初選失利，辭去閣揆職務，蔡英文隨之總辭。蔡英文要如何在三月便得知她五月便要辭職，然後會有人找她接任宇昌公司負責人？
7月底蔡英文被邀請擔任救火隊協助宇昌生技談判。成功後，Genentech要求我方在美國時間9月4日前完成設立公司、資金到位。當時僅有永豐餘集團的上智創投、統一集團的統一國際資金能及時到位。在時間壓力下，蔡英文說服蔡家先投資6千萬救火，即時完成60％的民間籌資，之後國發基金才依法撥款。而宇昌生技則遲了一天，於9月5日完成設立公司，由蔡英文擔任董事長。
10月份宇昌生技第二階段增資不順利，蔡家又再投資7200萬，所以共1億3200萬。但9月蔡英文已表示：蔡家僅做救火隊，於第二階段資金到位時，蔡家資金便會退出。
2008年5月，蔡英文當選民進黨主席後，辭去宇昌生技及台懋公司負責人。
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