98年8月8日莫拉克颱風侵襲臺灣，為臺東太麻里地區帶來重大災害，不僅居民家園遭洪水吞噬、太麻里溪堤防及護岸損毀、鐵路（南迴線）橋樑路基遭沖毀、公路（台9線）橋樑北端引道流失，是「受災最嚴重」、「重建最困難」、「河道變形最鉅」的「三最」重災區。緊急救難的物資一度用海軍的登陸艇搶灘運送上岸，困窘的情況可見一斑。
災害發生後，我在8月10日立刻趕到太麻里地區及當地部落了解災情，並指示行政院加速重建工作。一個多月後道路搶通，就立即規劃重建。100年5月我主持了南太麻里鐵公路橋樑改建的聯合開工典禮，102年4月完成台九線公路部分，提前了64天。鐵路南迴線部分則在103年1月開工，104年7月完成，提前119天。改建後的鐵公路橋皆改為增大跨距的橋樑，擴大了排洪斷面；並將鐵、公路橋樑的橋墩對齊，減少水位壅高的情況；橋墩使用1公分厚的防撞鋼鈑包覆，提升防洪能力；鐵路橋也預留未來鐵路電氣化與雙軌化的空間。目前工程皆已完工，且遠早於原訂完工日期，投入工程經費共約5.6億元。
另外，在行政院重建會、經濟部水利局及臺東縣政府的通力合作下，僅花了約2年2個月的時間，便成功復建總長超過1萬公尺的堤防與護岸，疏濬淤積土石100萬立方公尺，相比原先預訂的5年執行年限，提前2年10個月完成，效率十分的高！不但還地於河，也還地於民。迄今六年又來了多個颱風，都沒造成任何災害。
家園受到重創的原住民部落嘉蘭村，我們則以「離災不離村」的方式，為族人們規劃永久安置基地，並由紅十字會及臺灣世界展望會協助興建寬敞堅固的永久屋，讓300多位居民擁有紅瓦白牆的新家，遠眺景觀美不勝收。離部落不遠處利用剩餘經費建了一條「天空步道」，成為另一個觀光景點。我建議他們取一個別名─「嘉蘭棧道」─或可產生一些思古幽情。此外，也由原民會補助進行文化裝飾，將房屋外觀漆上太陽、老鷹羽毛、百步蛇等象徵排灣族的圖騰，發揚部落的歷史與文化，更有一戶人家的牆上畫了家族歷次遷移的歷史，十分罕見。
我常常說，「防災重於救災，離災優於防災」，天災或許無法預測，但損害可以預防，我們還是應該先做好萬全的準備。舉例來說，農委會在土石流潛在風險地區訓練了1300多位防災志工專員，在莫拉克風災時，便發揮了非常大的功能。南投縣水里鄉新山村村長林美玲女士，因受過防災專員的訓練，莫拉克颱風時驚覺雨勢情況不對，一戶戶打電話請村民撤離，有若干居民不太願意，她與夫婿騎機車挨家挨戶敲門勸說，終於將靠近河岸的村民全數撤離。事後證明如果她沒有這麼做，可能會造成至少60人以上的往生。莫拉克颱風後，我也特別頒獎表揚這些防災專員，他們讓全臺至少一千位民眾免於死亡的命運，政府也會持續落實防災制度，將災害帶來的損傷降到最低。
我們都知道，在重建的過程中，硬體建設不是最困難的，撫平因災害而受創的心靈更是關鍵。昨日，我再次來到嘉蘭村，看見的不再是滿目瘡痍，而是居民們臉上開心的笑容。對他們而言，新居已變成新家，新家將成為他們的新故鄉。新的生命力在部落中逐漸成長茁壯，新的故事即將展開，期盼上天與祖靈們守護部落、守護臺灣，永遠平安。他們送吳副總統跟我各一個大型的皮雕，上書「永遠的朋友」，讓我們非常感動。公路總局、鐵工局與水利署的同仁工程效率與品質都令人驚嘆，我要為他們按三個讚！
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